urodził się  22 stycznia 1945 w Skalsku koło Litomierzyc (dzisiaj Czechy). Po wojnie jego rodzina uciekła do Schruns w landzie Voralberg i tam wzrastał. Wstąpił do Zakonu Dominikanów mając 18 lat. Odbył studia filozoficzno-teologiczne w Walberberg pod Bonn, we Wiedniu i Paryżu i w roku 1970 został we Wiedniu wyświecony na kapłana przez ks. kard. Franciszka Koeniga. Następnie podjął studia doktoranckie w Paryżu i Ratyzbonie, gdzie jego nauczycielem był Józef Ratzinger- późniejszy papież Bendeykt XVI. Od tamtego czasu K. Schoenborn należy do grona uczniów Józefa Ratzingera, które spotyka się raz w roku.

W latach 1973-75 K.Schoenborn był duszpaterzem akademickim w Grazu, a następnie w latach 1975-91 wykładowcą teologii dogmatycznej oraz teologii kościołów wschodnich na uniwersytecie we Fryburgu w Szwajcarii. W 1980 roku został członkiem Międzynarodowej Komisji Teologicznej przy Stolicy Apostolskiej. W 1987 powołano go na funkcję sekretarza redakcji Katechizmiu Kościoła Katolickiego. W roku 1991 został biskupem pomocniczym Wiednia, a od 1995 roku arcybiskupem Archidieczji Wiedeńskiej i ordynariuszem wiernych obrządku bizantyjskiego w Ausrtii. W roku 1996 głosił rekolekcje wielkopostne dla papieża Jana Pawła II i kurii rzymskiej. Tego samego roku otrzymał palium.

W 1998 roku został powolany do kolegium kardynalskiego. Jest członkiem Kongregacji Wiary, Kongregacji Kościołów Wschodnich, Kongregacji ds. Edukacji Katolickiej, Papieskiej Rady Kultury oraz Papieskiej Rady ds. Nowej Ewangelizacji.

Jako motyw przwodni swego poługiwania biskupiego wybrał słowa Jezusa z ewangelii św.Jana