Franz Lackner wurde am 14. Juli 1956 in Feldbach in der Oststeiermark geboren. 1984 trat er in den Franziskanerorden in Reutte in Tirol ein und legte 1989 die Ewige Profess ab. Zum Priester geweiht wurde Lackner am 23. Juni 1991 in Graz. Von 1997 bis 1999 war er Professor für Metaphysik an der Ordenshochschule "Antonianum" der Franziskaner in Rom. Von 1999 bis 2002 war Lackner Provinzial der Wiener Franziskanerprovinz. Seit 1999 ist Franz Lackner Professor für Philosophie an der Philosophisch-Theologischen Hochschule Heiligenkreuz.
Franz Lackner ist Weihbischof der Diözese Graz-Seckau (und Titularbischof von Balecium), dazu wurde er am 23. Oktober 2002 ernannt. Die Bischofsweihe empfing er im Grazer Dom am 8. Dezember 2002.